Павел антипов уникс: Павел Антипов – ПБК Локомотив-Кубань – официальный сайт профессионального баскетбольного клуба

Новости

Main ⁄ Новости ⁄ Новости

06.03.2023

Новости команды

Концовка волжского дерби – за «Нижним»

05.03.2023

Новости команды

Превью. «Пари Нижний Новгород» vs УНИКС

05.03.2023

Новости команды

Ушел из жизни Александр Зрядчиков

03.03.2023

Молодежная

Сергей Полстянов – в символической пятерке февраля Единой молодежной Лиги ВТБ!

03. 03.2023

Интервью

Георгий Жбанов: «Мы могли бы быть в восьмерке сильнейших в Евролиге»

02.03.2023

Новости команды

ЦСКА прервал 7-матчевую выездную серию побед УНИКСа

01.03.2023

Новости команды

Превью. ЦСКА vs УНИКС

01.03.2023

Новости команды

С Днем рождения, Рустам Нургалиевич!

01. 03.2023

Новости команды

С Днем рождения, Шамиль Адгамович!

28.02.2023

Молодежная

Обменялись победами в волжском дерби

27.02.2023

Молодежная

УНИКС-2 дважды разобрался с «Автодором-2»

26.02.2023

Новости команды

Впервые в сезоне уступаем «Зениту»

26.02.2023

Новости команды

С Днем рождения, Станислав Георгиевич!

24. 02.2023

Новости команды

Превью. УНИКС vs «Зенит»

24.02.2023

Новости команды

С Днем рождения, Станислав!

23.02.2023

Новости команды

С Днем защитника Отечества!

23.02.2023

Новости команды

С Днем рождения, Нено!

21.02.2023

Новости команды

С Днем рождения, Юре!

20. 02.2023

Молодежная

УНИКС и Федерация баскетбола Республики Татарстан посетили Заинск

19.02.2023

Новости команды

У УНИКСа – рекордное представительство в Матче Звезд-2023!

Страницы: 1 2 3 4 5 … 237 След.

Павел Антипов, новости о персоне, последние события сегодня

Регистрация пройдена успешно!
Пожалуйста, перейдите по ссылке из письма, отправленного на

За период

материалов

Еще

Павел АнтиповБаскетбол

Еще

Павел АнтиповБаскетболНижний НовгородУНИКС

Еще

Павел АнтиповБаскетболДимитрис ПрифтисУНИКС

Еще

Павел АнтиповБаскетболЗенит (Санкт-Петербург)УНИКС

Еще

Павел АнтиповБаскетбол

Еще

Павел АнтиповБаскетболМужская сборная России по баскетболуУНИКС

Еще

Павел АнтиповБаскетболДимитрис ПрифтисУНИКСДжон Холланд

Еще

Павел АнтиповБаскетболУНИКСЕвгений Колесников

Еще

Павел АнтиповБаскетболКубок Европы FIBAУНИКС

Еще

ФутболВХЛТамбов

Еще

БаскетболВиталий ФридзонМатериалы РИА СпортЕдиная Лига ВТББК АвтодорЗенит (Санкт-Петербург)ПБК Локомотив-КубаньЦСКАНиколой МилутиновКевин Пангос

Еще

БаскетболЕдиная Лига ВТБНижний Новгород

Еще

Павел АнтиповБаскетболВалерий ЛиходейУНИКС

Еще

Павел АнтиповБаскетболНижний Новгород

Еще

Павел АнтиповБаскетболНижний Новгород

Еще

Павел АнтиповБаскетболАнтон АстапковичИван Стребков

Еще

Павел АнтиповБаскетболНижний НовгородЦСКА

Еще

Павел АнтиповБаскетболЛига чемпионов FIBAНижний НовгородБамберг

Еще

Павел АнтиповБаскетболСпортЗоран ЛукичНижний Новгород

Еще

Павел АнтиповБаскетболСпортНижний Новгород

Еще 20 материалов

Вход на сайт

Почта

Пароль

Восстановить пароль

Зарегистрироваться

Срок действия ссылки истек

Назад

Регистрация на сайте

Почта

Пароль

Я принимаю условия соглашения

Войти с логином и паролем

Ваши данные

Восстановление пароля

Почта

Назад

Восстановление пароля

Ссылка для восстановления пароля отправлена на адрес

Восстановление пароля

Новый пароль

Подтвердите пароль

Написать автору

Тема

Сообщение

Почта

ФИО

Нажимая на кнопку «Отправить», Вы соглашаетесь с Политикой конфиденциальности

Задать вопрос

Ваше имя

Ваш город

Ваш E-mail

Ваше сообщение

Сообщение отправлено!

Спасибо!

Произошла ошибка!

Попробуйте еще раз!

Обратная связь

Чем помочь?

Если ни один из вариантов не подходит,
нажмите здесь для связи с нами

Обратная связь

Чтобы воспользоваться формой обратной связи,
Вы должны войти на сайт.

Разблокировать аккаунт

Вы были заблокированы за нарушение
правил комментирования материалов

Срок блокировки — от 12 до 48 часов, либо навсегда.

Если Вы не согласны c блокировкой, заполните форму.

Назад

Разблокировать аккаунт

Имя в чате

Дата сообщения

Время отправки сообщения

Блокировался ваш аккаунт ранее?

ДаНет

Сколько раз?

Удалили мое сообщение

Ваше сообщение было удалено за нарушение
правил комментирования материалов

Если Вы не согласны c блокировкой, заполните форму.

Назад

Удалили мое сообщение

Чтобы связаться с нами, заполните форму ниже:

Ваше сообщение

Перетащите, или выберите скриншот

Связаться с нами

Если вы хотите пожаловаться на ошибку в материале, заполните форму ниже:

Ссылка на материал

Опишите проблему

Перетащите,
или выберите скриншот

Связаться с нами

Чтобы связаться с нами, заполните форму ниже:

Ваше сообщение

Перетащите,
или выберите скриншот

Показать

Павел Антипов — petnapet

от Leandro gradaШевич, размещенная в Reprezentativna koШярке

Ruski Izbornik Sergei Bazarevich J Eadresirao Fiba-i Popis od 15 Imena Nake-wri. minulog europskog prvenstva gostovati u  Bosni I Hercegovini  (24.11) i ugostiti Belgiju (27.11).

Бабурин Евгений , Дмитрий Кулагин, Дмитрий Хвостовой, Павел Антипов, Станислав Илницки (Локомотива Кубан)

, Иван Укхов ( Parma ), Vitajy Fridzon, Mikhail Kulagin I Semen Antonovs Antonov. Nikita Balashov ( Peno ), Evgeny Valiev, Sergei Karasev ( Zenit Sankt Petersburg ), Andrey Zubkov ( Khimki Moskovska uppast) , Vladislavavavkikna7 , , Vladislavavavavavka , , Vladislavav7 , , , , , , , , .0008 ) i Артем Клименко (Автодор Саратов).

ZBOG FIBA-INE PRAMJENE KALENDARA PRVI KVALIFIKACIJSKI PROZOR ć PRESKOčITI NAJBOLJI IGRACHI Алексей Шведский (Himki Moskovska Ollast), Moslavska illastska), , , , , ), , ,

, ), ), ). Означено Алексей Швед, Андрей Воронцевич, Андрей Зубков, Артем Клименко, Дмитрий Хвостов, Дмитрий Кулагин, Евгений Бабурин, Евгений Валиев, Иван Ухов, Михаил Куалгин, Никита Балашов, Никита Курбанов, Павел Антипов, Русия, Семен Антонов, Станислав Ильницкий, Станислав Иницкий , Тимофей Мозгов, Виталий Фридзон, Владислав ТрушкинКоменты

от Leandro GradaШевич, размещенная в Aba Liga

U Finalu Kupa Mega Bemax 2017 Lokomotiv Kuban Je Pobijedio Organizator MEGU ), 855), 855, ), 9000, 9000, 9000, 9000, ), ). Редовима били по Крис Бэбб по 20 и Джо Рэгланд по 18 лет,13 по Райан Брокхофф, 12 по Павел Антипов ,по 2 поэна Манже Треворевалы , суверенный

Экипу Деяна Милоевича в 21 поэме предводили Дилан Эннис и Никола Реби ć,17 je dodao Стефан Синовец.

Означено Брайан Квале, Крис Бэбб, Деян Милоевич, Дилан Эннис, Джо Рэгланд, Локомотив-Кубань, Мега Лекс, Никола Ребич, Павел Антипов, Райан Брокхофф, Станислав Ильницкий, Стефан Синовец, Тревор ЛейсиКоментираж

Леандро Градашчевич, опубликовано в ABA Liga

У другого полуфинального сусрету Купа Мега Бемакс 2017 Л окомотив Кубани Саше Обрадовича на уровне обращения с Партизаном (97:75).

Kuba Su Do Pobjede odveli Američki Internacionalci Джо Рагленд S A 21 I Brian Qvale SA 16 POENA, 15 Poena Postigao Je Mardy Collins , 12 Odnosno 11 Poena Postigli Suipor. poen manje dodao je Иван Нелюбов.

Najefikasniji u redovima Partizana bio je Nigel Willams-Goss sa 17 poena, 11 je postigao Mihajlo Andrić , poen manje dodao je Tom Wilson,

Означено Брайан Квале, Иван Нелыбуов, Джо Рэгланд, Локомотив-Кубань, Марди Коллинз, Михайло Андрич, Найджел Уильямс-Госс, Партизан, Павел Антипов, Том Уилсон, Тревор ЛейсиКоментираж

Леандро Градашчевич, размещено в Евролиге

После 30. кола Евролиги, вышедшем на Реал Мадрид,ЦСКА и Уникс

Реал Мадрид-Анадолу Эфес-97-80

Служба поддержки за уважением Победа Джейси Кэрролла (22 минуты, 29 побед, 10/11 фг и 7 тройки) и Dontaye Draper (20 минут, 16 побед, 5/6) fh i 4 тройка).

Посетители Брайанта Данстона (15 очков, 6/10 фг и 10 очков) и Деррика Брауна (14 очков и 8 очков), 13 очков (6/11 фг) и 6 помощников Томаса Хёртеля, 11 очков (5 /9 ff) и 5 ​​лет назад, как ДеШон Томас, несколько человек из 3-х тройке и 2-х украинских лет назад, как Тайлер Ханикатт.

Real Cwe se u etvrtfinalnoj seriji obračunati sa Darussafakom, dok će Perasov tim na noge Olympiakosu.

ЦСКА Москва-Олимпиакос-90-86

Армия за команду 23 победителя одвеос бековски тандем Де Коло (8/15 фг,6 ассистенция и 3 тройки)-Теодосич (7/12 фг,4 ассистенции,3 тройки и 2 украинских очках), 12 очков (2/4 фг) с участием Кори Хиггинса, 11 очков (5/7 фг) и 3 лет подряд с участием Андрея Воронцевича, много очков (2/3 фг) и 6 очков додао с Кайлом Хайнсом.

Госте су са 16 poena predvodili Vassilis Spanoulis (5/10 fg, 7 ассистенция и 2 украинских лопасти) i Ioannis Papapetrou 6/12 fog и 4 trojke), 13 poena, 4 zkoka и 3 asistencije nanizao je Kostas Papanikolsou, po poen manje dodali su Vangelis Mantzaris (5/8 fg, 4 asistencije i 3 ukradene lopte) i Giorgos Printezis (5/6 fg i 7 skokova).

CSKA će u četvrtfinalu imati sraz sa Baskonijom,dok će Olympiakosov rival Panathinaikos  imati prednost domaćeg parketa u srazu sa Obradovićevim Fenerom

Emporio Armani Milano-Unics Kazan-68-91

Najzaslužniji za uvjerljivu pobjedu Unicsa bio je Latovios Williams sa 20 poena (8/9 fg) и 12 очков, 13 poena и 5 помощников, таких как Keith Langford, 12 poena, 6 помощников и 5 очков, nanizao je Quino Colom, 11 poena (4/5 fg), 4 процента и 3 тройки upisao je Котти Кларк, в 3-х победах достались Марко Баничу (4/5 фг и 3 украинских очках), Вадиму Панину (3/3 фг) и Павлу Антипову.

Домчине предводили Давиде Пасколо (18 лет, 8/14 фг и 3 года) и Раким Сандерс (14 лет, 3 года и 2 украинца).

 

 

 

Означено Анадолу Эфес, Андрей Воронцевич, Брайант Данстон, Кори Хиггинс, Котти Кларк, ЦСКА Москва, Давиде Пасколо, ДеШон Томас, Донтэй Дрейпер, Евролига, Йоргос Принтезис, Джейси Кэрролл, Кит Лэнгфорд, Костас Папаниколау, Кайл Хайнс, Латовиус Уильямс, Марко Банич , Милош Теодосич, Нандо Де Коло, Олимпия Милан, Олимпиакос, Павел Антипов, Куино Колом, Раким Сандерс, Реал Мадрид, Томас Хёртель, Тайлер Ханикатт, УНИКС Казань, Вангелис Манцарис, Василис Спанулис, Веймир ПерасовичКомментарий

автор djordje1995, размещено в Евролиге

Реал Мадрид – Црвена Звезда 98-68

Надежды в экипировке Пабла Ласа с 12 победами на Густаво Айона (6 баллов и 5 и помощь), Йонаса Мациулиса (4 тройки и 2 украинца) и Джеффри Тейлора ( 4/6 fg), poen mamje dodali su Sergio Llull  (10 ассистенций), Othello Hunter (4/4;fg и 8 очков) и Anthony Randolph (5 очков и 3 тройки).

Ekipu Dejana Radonjića, koja je grala bez Stefana Jovića, predvodio je Marko Simonović sa 13 poena dok je solidan bio and Charles Jenkins sa 10 poena i pet asistencija.

Anadolu Efes -Bamberg 68-87

Bamberg je u ovom kolu došao do iznanađujuće pobjede mod Lerasovog Efesa. До великого триумфа Nijemce su odveli Leon Radošević (16 poena 8/9 fg и 5 skokova), Maodo Lo (15 poena 5/8 fg) и Darius Miller (14 poena 6/7 fg и 6 skokova).

Перасову экипу предводили Су Седи Осман (15 поэна 5/11 фг до 7 лет) и Деррик Браун (13 поэна 5/12 фг и 4 часа).

Олимпиакос – Дарусафака 81-73

Пирейце по победе предводили Кхем Берч (13 очков 5/5 фг и 8 скоков), Мэтт Ложески (12 энтузиастов, 4/7 фг и 4 скока) и Эрик Грин с 11 энтузиастами.

Дарусафаку на предводили Брэда Ванамейкера (23 поэмы, 7/14 фг и помощника) и Уилла Клайберна (20 поен и 7 лет).

Жальгирис – Панатинаикос 64-58

Жальгирис на великом победе владельца Лео Вестерманн (14 поэнов, 6 посещений и 6 помощников) и Артураса Милакниса (13 поен и 3 тройки), по 2 поначалу многие додали и по Брок Мотум (4 пополам) ) и Паулюс Янкунас (8;скокова и 2 украинские лопте).

U redovima Panate se istaknuo trio Pappas (13 poena и 3 skoka)-Singleton (11 poena,6 skokova,3 blokade и 2 ukradene lopte)-Bourousis (10 poena и 5 skokova).

Барселона – Уникс Казань 70-62
Блауграну по важному владельцу Стратос Перпероглу (13 очков, 5/9 фг за 3 секунды и 3 украинских очка) и Виктор Клавер (12 очков, 4/6 фг и 2 украинских очка).

Goste koji su igrali bez Keitha Langforda predvodio je tandrm  Antipov (12 poena)-Colom (10 poena,8 asista i 3 skoka).

Маккаби – Милан 92-82
Маккаби по имени Виктора Радда (17 баллов, 7/12 фг), Колтона Айверсона (16 баллов, 6/8 фг и 9 часов) и DJ Selley (15 баллов, 6/10) fg i 7 asista).
Большое количество оставшихся у исправлений Шминкера били су Ракима Сандерса (19 poena, 7/17fg) te Awudu Abass (13 poena, 3/8fg te četiri skoka)

Означено Анадолу Эфес, Энтони Рэндольф, Артурас Милакнис, Авуду Абасс, Барселона Ласса, Брэд Ванамакер, Брок Мотум, Седи Осман, Чарльз Дженкинс, Крис Сингетон, Колтон Айверсон, Д. Дж. Сили, Дариус Миллер, Деян Радонич, Деррик Браун, Догус Даруссафака, Эрик Грин, Евролига, Густаво Айон, Иоаннис Бурузис, Джеффри Тейлор, Йонас Мачулис, Кит Лэнгфорд, Хем Берч, КК Црвена Звезда Телеком, Лео Вестерман, Леон Радошевич, Маккаби Тел. Авив, Маодо Ло, Марко Симонович, Мэтт Лоески, Никос Паппас, Олимпия Милан, Олимпиакос, Отелло Хантер, Пабло Ласо, Панатинаикос, Паулиус Янкунас, Павел Антипов, Куино Колом, Раким Сандерс, Реал Мадрид, Серхио Лулль, Стефан Йович, Стратос Перпероглу , УНИКС Казань, Веймир Перасович, Виктор Клавер, Виктор Радд, Уилл Клайберн, Жальгирис КаунасКомментарии

Леандро Градашчевич, размещено в Евролиге

U 21.kolu Eurolige nvoe trijumfe su upisali: Fenerbahce, Žalgiris, Olympiacos i Bamberg.

Фенербахче- ЦСКА Москва -77-71

Najzaslužniji za veliki trijumf  Obradovićevog tima bili su; Ekpe Udoh (15 poena,6/8 fg,11 skokova i 2 blockade) и Богдан Богданович (11 poena и 8 asista),10  poena i 6 skokova dodao je Гиги Датоме .

Moskovljane je sa 23 poena (4 trojke),4 asista i 3 skoka predvodio Nando De Colo ,11 poena,3 skoka,3 asista i 2 ukradene lopte dodao je Cory Higgins .

žalgiris kaunas- Barcelona Lassa -89-85

Najefikasniji U Pobjedičkom Timu Sa 17 Poena Bili Su: Lukas Lekavičuus (8/10 FG, 5 Skokova I 40007777777. fg, 4 skoka и 4 asista), 15 poena (4/7 fg) и 4 skoka upisao je Паулюс Янкунас ,poen manje uz 4 trojke dodao je Артурас Милакнис .

Надежный и проверенный завод, био и легендарный Хуан Карлос Наварро (17 баллов, 4 шага и 3 тройки), по 12 баллов, добавленных в Петтери Копонен, и Тайрес Мане, (7 запасов), рис (7 запасов), Додали су Витор Фаверани (5 скоков) и Джастин Доэллман (5 скоков).

УНИКС Казань -Олимпиакос-75-90

Najefikasniji u pobjedničkim redovima bili su Erick Green (25 баллов, 10/15 фг, 3 стакана и 3 тройки) и Giorgos Printezis (20 пеней, 9/13 фг, 4 помощника, 3 тройки и 3 стакана), 11 poena (5/7 fg) и 7 скока upisao je Nikola Milutinov , poen manje uz 4 asista 3 skoka dodao je Kostas Papnikolaou.

У домашнем времени истакнуо се Кейт Лэнгфорд (25 poena,7 asista i 3 trojke),17 poena (7/9) i 3 ukradene lopte upsiao je Павел Антипов ,2 poena manje uz 6 skokova i 3 asista dodao je Артем Параховский.

Brose Baskets Bamberg- Maccabi Fox Tel Aviv -90-75

Bamberg su do osme pobjede vodili Janis Strelnieks (25 poena, 10/10 ft, 5 trojki i 90 9007 (0 Dar 80 trojki i 4 asista) 17 poena, 7/10 fg), 13 poena (4/6 fg) и 3 тройки upisao je Maodo Lo , 3 poena manje uz 5 skokova и 2 poena dodao je Daniel Theis .

Эндрю Гудлок (22 поэна и 3 тройки) и Д.Дж. Seeley s (19 poena) для najefikasniji u redovima Maccabija.

 

 

 

 

Означено Эндрю Гудлок, Барселона Ласса, Богдан Богданович, Броуз Баскетс, Кори Хиггинс, ЦСКА Мсоква, Д.Дж. Сили, Дариус Миллер, Догус Даруссафака, Экпе Удох. , Эрик Грин, Евролига, Фенербахче, Гиоргос Принтезис, io, Янис Стрельниекс, Джастин Доэллман, Кит Лэнгфорд, Костас Папниколау, Луиджи Датоме, Лукас Лекавичюс, Маккаби Тель-Авив, Маодо Ло, Нандо Де Коло, Никола Милутинов, Олимпиакос, Паулиус Янкунас, Павел Антипов, Петтери Копонен, Тайриз Райс, УНИКС Казань, Витор Фаверани, Жальгирис Каунас, Желько ОбрадовичКомментарии

от Leandro gradaШевич, опубликованный в Euroliga

Izraelski Velikan Maccabi Je do nove Gostujuće Pobjede Stigao Kod .

Junak gostiju bio je Devin Smith (16 poena и 6 skokova), 12 poena и 6 skokova nanizao je Colton Iverson, poen manje uz 6 skokova and 4 asista dodao je D.J. Сили.

Standardno najbolji kod domaćina bio je Кит Лэнгфорд ( 22 poena i 3 asista), 12 poena postigao je Павел Антипов , 2 poena manje (fg 4/5) dodao je hrvatski internacionalac Marko Banić ( Ridl Basketball Agency ).

Означено Колтон Айверсон, Д.Дж. Сили, Девин Смит, Кит Лэнгфорд, Маккаби Тель-Авив, Марко Банич, Павел Антипов, Баскетбольное агентство Ридл., УНИКС КазаньКомментарии

SPAdes – Центр Алгоритмической Биотехнологии

Все о вирусах: новые коронаSPAdes, rnviralSPAdes и метавирусныеSPAdes пайплайны.

См. изменения в журнале изменений

Загрузить двоичные файлы SPAdes для Linux (только 64-разрядная версия)

Загрузить двоичные файлы SPAdes для MacOS

Загрузить исходный код SPAdes

  • Руководство по SPAdes с руководством по установке (версия 3.15.4)
  • То же руководство SPAdes в уценке
  • РНКСПАдес ручной
  • Руководство по truSPAdes (устарело)
  • SPAdes на наборах данных GAGE-B эталонный тест
  • Контрольный показатель для других наборов данных

Если у вас возникли проблемы с запуском SPAdes, вы можете найти похожую проблему в нашем репозитории GitHub, создать новый или написать нам по электронной почте: *protected email*.

Обратите внимание, что исполняемые файлы SPAdes могут не работать на новых ядрах Linux.

Подпишитесь на @spadesassembler или подпишитесь ниже

Примечание: для этого контента требуется JavaScript.

  • МДА одноклеточный E. coli ; 6,3 Гб, 29 млн операций чтения, 2 x 100 п.н., размер вставки ~ 270 п.н. (Illumina Genome Analyzer IIx)
  • Стандартный изолят E. coli ; 6,2 Гб, 28 млн прочтений, 2×100 п.н., размер вставки ~ 215 п.н. (Illumina Genome Analyzer IIx), также доступен в NCBI SRA (ERR008613)
  • MDA одноклеточный S. aureus ; 14,6 Гб, 33 млн чтений, 2 x 100 п.н., размер вставки ~ 214 п.н. (Illumina Genome Analyzer IIx)

Дополнительные наборы данных, а также эталонные геномы доступны здесь.

E. coli K-12 MG1655 эталонная длина составляет 4639675 п.н. с 4324 аннотированными генами. S. aureus   USA300 FPR3757 (хромосома и три плазмиды) эталонная длина составляет 2

9 п. н. с 2622 аннотированными генами.

Учитывались только контиги длиной 500 п.н. и длиннее. Таблицы были получены с использованием QUAST 4.6.3.

Сборка НГ50 # контигов Крупнейший Общая длина МА ММ ИНД ГФ (%) # гены
Одноклеточные E. coli
А5 14399 745 101584 4441145 3 11,92 0,19 89,867 3443
БЕЗДНА 68534 179 178720 4345617 6 3,49 0,83 88,265 3704
CLC 32506 503 113285 4656964 1 5,54 1,00 92. 286 3767
ЭЙЛЕР-SR 26662 429 140518 4248713 12 9,98 20.17 84,846 3410
Рэй 45448 361 210820 4379139 16 5,29 1,24 88,345 3634
СОАПденово 1540 1166 51517 2958144 1 1,49 0,11 57,668 1766
Бархат 22648 261 132865 3501984 2 2,19 1,17 73,761 3079
Э+В-СК 32051 344 132865 4540286 2 2,26 0,70 91,727 3767
IDBA-UD contigs 98306 244 284464 4814043 3 4,37 0,23 95. 158 4041
Подмости IDBA-UD 109057 229 284464 4813609 3 4,42 0,75 95.145 4046
SPAdes 3.12 contigs 105885 231 268283 4795250 3 2,02 0,30 94.853 4028
SPAdes 3.12 подмости 117600 214 285212 4800301 3 2,41 0,61 94. 886 4030
Изолят E. coli
А5 43651 176 181690 4551797 0 0,40 0,09 98.017 4163
АБИСС 106155 96 221861 4619631 2 3,72 0,37 98,969 4241
КЛК 86964 112 221549 4550314 1 0,99 0,18 98. 057 4202
ЭЙЛЕР-SR 110153 100 221409 4574240 4 3,14 5,43 98.092 4182
Рэй 86246 98 221942 4634429 1 1,42 0,09 96,865 4136
СОАПденово 49626 181 165487 4535469 0 0,15 0,09 97,696 4132
Бархат 82776 120 242032 4554702 3 2,44 0,35 98. 131 4190
Э+В-СК 54856 171 166115 4539639 0 1,30 0,11 97,792 4134
IDBA-UD contigs 106844 110 221687 4565529 3 3,40 0,24 98,269 4200
Подмости IDBA-UD 133098 93 284363 4565454 4 4,08 0,55 98. 282 4208
SPAdes 3.12 contigs 125485 88 224545 4555008 1 1,93 0,18 98.092 4197
SPAdes 3.12 подмости 133189 83 264976 4555437 1 1,98 0,22 98.090 4197
Одноэлементный S. aureus
А5 4829 937 41828 2770402 2 24,59 0,30 91,579 1815
АБИСС 43173 185 175286 2899223 3 6,46 0,50 96.572 2458
ЭЙЛЕР-SR 7247 750 66549 2988161 29 21,79 10,78 94,395 2009
Рэй 62026 84 125177 2947717 12 1,40 0,44 92,960 2410
СОАПденово 510 1047 27317 1473402 0 1,32 0,29 46. 717 595
Бархат 15656 347 67677 2746768 3 4,41 4,27 93.181 2274
Э+В-СК 32296 215 107657 2932416 5 6,89 5,03 97,497 2476
IDBA-UD contigs 87549 114 175236 2996997 4 2,47 0,76 98. 658 2568
Подмости IDBA-UD 111392 99 210360 2996115 4 2,54 1,46 98.681 2574
SPAdes 3.12 contigs 174343 79 329332 2992317 4 2,68 0,49 98.483 2582
SPAdes 3.12 подмости 195326 75 429070 2993815 4 2,96 0,49 98. 484 2582

A5 и CLC 3.22.55708 запускались с параметрами по умолчанию. ABySS 1.3.5, EULER-SR 2.0.1, Ray 2.2.0, SOAPdenovo 2.04, Velvet 1.2.07 и E+V-SC были запущены с размером вершины 55. IDBA-UD 1.1.0 был запущен в итерации по умолчанию. режим.

Общий размер сборки может увеличиваться (и в некоторых случаях превышать размер генома) из-за загрязнений (см. Chitsaz et al. (2011)), неправильно собранных контигов, повторов и хабов, которые способствуют множественным контигам. Процент 9Охваченные геномы 0408 E. coli и S. aureus отфильтровывают эти проблемы (столбец GF (%), фракция генома (%)).

Статистика NG50 такая же, как у N50, за исключением того, что используется размер генома, а не размер сборки.

Неправильные сборки (MA) — это места в собранном контиге, где левая фланкирующая последовательность выравнивается на расстоянии более 1 т.п.о. от правой фланкирующей последовательности в эталоне.

Частота ошибок несоответствия (подстановки) (MM) и количество вставок (IND) на 100 кбит/с измеряются в выровненных областях контигов.

В каждой колонке лучшие сборщики по данному критерию выделены жирным шрифтом . Сравнительный анализ гибридных сборок

SPAdes 3.12 на наборах данных Illumina + PacBio E. coli .

Сборка НГ50 # контигов Самый большой Общая длина МА ММ ИНД ГФ (%) # гены
E. coli K-12 Только Illumina
SPAdes 3. 12 contigs 125485 99 224454 4557432 0 2,53 0,33 98.136 4196
E. coli K-12 Illumina + PacBio P4
SPAdes 3.12 contigs 4640965 5 4640965 4643912 0 (6*) 11.41 1,12 99,968 4320
SPAdes 3.12 подмости 4640965 5 4640965 4643912 0 (6*) 11. 41 1,12 99,968 4320

* Неправильные сборки не соответствуют действительности и соответствуют разнице по отношению к эталону

Для контрольных показателей, которые мы использовали:

  • E. coli K-12 MG1655 Стандартный изолят Illumina 90 набор данных3, указанный выше 90 набор данных86
  • E. coli K-12 MG1655 Набор данных PacBio RS II C2/P4 доступен в PacBio DevNet

SPAdes 3.12 Тестирование IonTorrent на наборе данных E. coli .

Сборка НГ50 # контигов Самый большой Общая длина МА ММ ИНД ГФ (%) # гены
SPAdes 3.12 contigs 133154 85 285138 4572473 3 3,44 3,39 98. 459 4204
SPAdes 3.12 подмости 133154 83 285138 4572673 3 3,44 3,39 98.459 4204

 


«Я хотел бы поблагодарить вас за отличную работу, которую вы делаете со SPAdes. Это очень полезная программа!»

Лайонел Гай

Уппсальский университет, Швеция

«Спасибо за ваш замечательный ассемблер SPAdes, мы успешно собрали несколько культивируемых организмов, и ваш ассемблер всегда работал лучше других ассемблеров при работе на PE- и/или Обычно мы используем данные MP MiSeq».

Доктор Харальд Р. Грубер-Водицка

Symbiosis Group

Институт морской микробиологии им. Макса Планка, Бремен, Германия

«Я использовал SPAdes для исправления ошибок в данных метатранскриптома, и это значительно улучшило качество данных.

Добавить комментарий

Ваш адрес email не будет опубликован. Обязательные поля помечены *