Павел антипов уникс: Павел Антипов – ПБК Локомотив-Кубань – официальный сайт профессионального баскетбольного клуба
Новости
Main ⁄ Новости ⁄ Новости
06.03.2023
Новости команды
Концовка волжского дерби – за «Нижним»
05.03.2023
Новости команды
Превью. «Пари Нижний Новгород» vs УНИКС
05.03.2023
Новости команды
Ушел из жизни Александр Зрядчиков
03.03.2023
Молодежная
Сергей Полстянов – в символической пятерке февраля Единой молодежной Лиги ВТБ!
03. 03.2023
Интервью
Георгий Жбанов: «Мы могли бы быть в восьмерке сильнейших в Евролиге»
02.03.2023
Новости команды
ЦСКА прервал 7-матчевую выездную серию побед УНИКСа
01.03.2023
Новости команды
Превью. ЦСКА vs УНИКС
01.03.2023
Новости команды
С Днем рождения, Рустам Нургалиевич!
01. 03.2023
Новости команды
С Днем рождения, Шамиль Адгамович!
28.02.2023
Молодежная
Обменялись победами в волжском дерби
27.02.2023
Молодежная
УНИКС-2 дважды разобрался с «Автодором-2»
Новости команды
Впервые в сезоне уступаем «Зениту»
26.02.2023
Новости команды
С Днем рождения, Станислав Георгиевич!
24. 02.2023
Новости команды
Превью. УНИКС vs «Зенит»
24.02.2023
Новости команды
С Днем рождения, Станислав!
23.02.2023
Новости команды
С Днем защитника Отечества!
23.02.2023
Новости команды
С Днем рождения, Нено!
21.02.2023
Новости команды
С Днем рождения, Юре!
20. 02.2023
Молодежная
19.02.2023
Новости команды
У УНИКСа – рекордное представительство в Матче Звезд-2023!
Страницы: 1 2 3 4 5 … 237 След.
Павел Антипов, новости о персоне, последние события сегодня
Регистрация пройдена успешно!
Пожалуйста, перейдите по ссылке из письма, отправленного на
За период
материалов
Еще
Павел АнтиповБаскетбол
Еще
Павел АнтиповБаскетболНижний НовгородУНИКС
Еще
Павел АнтиповБаскетболДимитрис ПрифтисУНИКС
Еще
Павел АнтиповБаскетболЗенит (Санкт-Петербург)УНИКС
Еще
Павел АнтиповБаскетбол
Еще
Павел АнтиповБаскетболМужская сборная России по баскетболуУНИКС
Еще
Павел АнтиповБаскетболДимитрис ПрифтисУНИКСДжон Холланд
Еще
Павел АнтиповБаскетболУНИКСЕвгений КолесниковЕще
Павел АнтиповБаскетболКубок Европы FIBAУНИКС
Еще
ФутболВХЛТамбов
Еще
БаскетболВиталий ФридзонМатериалы РИА СпортЕдиная Лига ВТББК АвтодорЗенит (Санкт-Петербург)ПБК Локомотив-КубаньЦСКАНиколой МилутиновКевин Пангос
Еще
БаскетболЕдиная Лига ВТБНижний Новгород
Еще
Павел АнтиповБаскетболВалерий ЛиходейУНИКС
Еще
Павел АнтиповБаскетболНижний Новгород
Еще
Павел АнтиповБаскетболНижний Новгород
Еще
Павел АнтиповБаскетболАнтон АстапковичИван Стребков
Еще
Павел АнтиповБаскетболНижний НовгородЦСКА
Еще
Павел АнтиповБаскетболЛига чемпионов FIBAНижний НовгородБамберг
Еще
Павел АнтиповБаскетболСпортЗоран ЛукичНижний Новгород
Еще
Павел АнтиповБаскетболСпортНижний Новгород
Еще 20 материалов
Вход на сайт
Почта
Пароль
Восстановить пароль
Зарегистрироваться
Срок действия ссылки истек
Назад
Регистрация на сайте
Почта
Пароль
Я принимаю условия соглашенияВойти с логином и паролем
Ваши данные
Восстановление пароля
Почта
Назад
Восстановление пароля
Ссылка для восстановления пароля отправлена на адрес
Восстановление пароля
Новый пароль
Подтвердите пароль
Написать автору
Тема
Сообщение
Почта
ФИО
Нажимая на кнопку «Отправить», Вы соглашаетесь с Политикой конфиденциальности
Задать вопрос
Ваше имя
Ваш город
Ваш E-mail
Ваше сообщение
Сообщение отправлено!
Спасибо!
Произошла ошибка!
Попробуйте еще раз!
Обратная связь
Чем помочь?
Если ни один из вариантов не подходит,
нажмите здесь для связи с нами
Обратная связь
Чтобы воспользоваться формой обратной связи,
Вы должны войти на сайт.
Разблокировать аккаунт
Вы были заблокированы за нарушение
правил комментирования материалов
Срок блокировки — от 12 до 48 часов, либо навсегда.
Если Вы не согласны c блокировкой, заполните форму.
Назад
Разблокировать аккаунт
Имя в чате
Дата сообщения
Время отправки сообщения
Блокировался ваш аккаунт ранее?
ДаНет
Сколько раз?
Удалили мое сообщение
Ваше сообщение было удалено за нарушение
правил комментирования материалов
Если Вы не согласны c блокировкой, заполните форму.
Назад
Удалили мое сообщение
Чтобы связаться с нами, заполните форму ниже:
Ваше сообщение
Перетащите, или выберите скриншот
Если вы хотите пожаловаться на ошибку в материале, заполните форму ниже:
Ссылка на материал
Опишите проблему
Перетащите,
или выберите скриншот
Связаться с нами
Чтобы связаться с нами, заполните форму ниже:
Ваше сообщение
Перетащите,
или выберите скриншот
Показать
Павел Антипов — petnapet
от Leandro gradaШевич, размещенная в Reprezentativna koШярке
Ruski Izbornik Sergei Bazarevich J Eadresirao Fiba-i Popis od 15 Imena Nake-wri. minulog europskog prvenstva gostovati u Bosni I Hercegovini (24.11) i ugostiti Belgiju (27.11).
Бабурин Евгений , Дмитрий Кулагин, Дмитрий Хвостовой, Павел Антипов, Станислав Илницки (Локомотива Кубан)
, Иван Укхов ( Parma ), Vitajy Fridzon, Mikhail Kulagin I Semen Antonovs Antonov. Nikita Balashov ( Peno ), Evgeny Valiev, Sergei Karasev ( Zenit Sankt Petersburg ), Andrey Zubkov ( Khimki Moskovska uppast) , Vladislavavavkikna7 , , Vladislavavavavavka , , Vladislavav7 , , , , , , , , .0008 ) i Артем Клименко (Автодор Саратов).ZBOG FIBA-INE PRAMJENE KALENDARA PRVI KVALIFIKACIJSKI PROZOR ć PRESKOčITI NAJBOLJI IGRACHI Алексей Шведский (Himki Moskovska Ollast), Moslavska illastska), , , , , ), , ,
от Leandro GradaШевич, размещенная в Aba Liga
U Finalu Kupa Mega Bemax 2017 Lokomotiv Kuban Je Pobijedio Organizator MEGU ), 855), 855,
), 9000, 9000, 9000, 9000, ), ). Редовима били по Крис Бэбб по 20 и Джо Рэгланд по 18 лет,13 по Райан Брокхофф, 12 по Павел Антипов ,по 2 поэна Манже Треворевалы , суверенныйЭкипу Деяна Милоевича в 21 поэме предводили Дилан Эннис и Никола Реби ć,17 je dodao Стефан Синовец.
Означено Брайан Квале, Крис Бэбб, Деян Милоевич, Дилан Эннис, Джо Рэгланд, Локомотив-Кубань, Мега Лекс, Никола Ребич, Павел Антипов, Райан Брокхофф, Станислав Ильницкий, Стефан Синовец, Тревор ЛейсиКоментиражЛеандро Градашчевич, опубликовано в ABA Liga
У другого полуфинального сусрету Купа Мега Бемакс 2017 Л окомотив Кубани Саше Обрадовича на уровне обращения с Партизаном (97:75).
Kuba Su Do Pobjede odveli Američki Internacionalci Джо Рагленд S A 21 I Brian Qvale SA 16 POENA, 15 Poena Postigao Je Mardy Collins , 12 Odnosno 11 Poena Postigli Suipor. poen manje dodao je Иван Нелюбов.
Najefikasniji u redovima Partizana bio je Nigel Willams-Goss sa 17 poena, 11 je postigao Mihajlo Andrić , poen manje dodao je Tom Wilson,
Означено Брайан Квале, Иван Нелыбуов, Джо Рэгланд, Локомотив-Кубань, Марди Коллинз, Михайло Андрич, Найджел Уильямс-Госс, Партизан, Павел Антипов, Том Уилсон, Тревор ЛейсиКоментиражЛеандро Градашчевич, размещено в Евролиге
После 30. кола Евролиги, вышедшем на Реал Мадрид,ЦСКА и Уникс
Реал Мадрид-Анадолу Эфес-97-80
Служба поддержки за уважением Победа Джейси Кэрролла (22 минуты, 29 побед, 10/11 фг и 7 тройки) и Dontaye Draper (20 минут, 16 побед, 5/6) fh i 4 тройка).
Посетители Брайанта Данстона (15 очков, 6/10 фг и 10 очков) и Деррика Брауна (14 очков и 8 очков), 13 очков (6/11 фг) и 6 помощников Томаса Хёртеля, 11 очков (5 /9 ff) и 5 лет назад, как ДеШон Томас, несколько человек из 3-х тройке и 2-х украинских лет назад, как Тайлер Ханикатт.
Real Cwe se u etvrtfinalnoj seriji obračunati sa Darussafakom, dok će Perasov tim na noge Olympiakosu.
ЦСКА Москва-Олимпиакос-90-86
Армия за команду 23 победителя одвеос бековски тандем Де Коло (8/15 фг,6 ассистенция и 3 тройки)-Теодосич (7/12 фг,4 ассистенции,3 тройки и 2 украинских очках), 12 очков (2/4 фг) с участием Кори Хиггинса, 11 очков (5/7 фг) и 3 лет подряд с участием Андрея Воронцевича, много очков (2/3 фг) и 6 очков додао с Кайлом Хайнсом.
Госте су са 16 poena predvodili Vassilis Spanoulis (5/10 fg, 7 ассистенция и 2 украинских лопасти) i Ioannis Papapetrou 6/12 fog и 4 trojke), 13 poena, 4 zkoka и 3 asistencije nanizao je Kostas Papanikolsou, po poen manje dodali su Vangelis Mantzaris (5/8 fg, 4 asistencije i 3 ukradene lopte) i Giorgos Printezis (5/6 fg i 7 skokova).
CSKA će u četvrtfinalu imati sraz sa Baskonijom,dok će Olympiakosov rival Panathinaikos imati prednost domaćeg parketa u srazu sa Obradovićevim Fenerom
Emporio Armani Milano-Unics Kazan-68-91
Najzaslužniji za uvjerljivu pobjedu Unicsa bio je Latovios Williams sa 20 poena (8/9 fg) и 12 очков, 13 poena и 5 помощников, таких как Keith Langford, 12 poena, 6 помощников и 5 очков, nanizao je Quino Colom, 11 poena (4/5 fg), 4 процента и 3 тройки upisao je Котти Кларк, в 3-х победах достались Марко Баничу (4/5 фг и 3 украинских очках), Вадиму Панину (3/3 фг) и Павлу Антипову.
Домчине предводили Давиде Пасколо (18 лет, 8/14 фг и 3 года) и Раким Сандерс (14 лет, 3 года и 2 украинца).
Означено Анадолу Эфес, Андрей Воронцевич, Брайант Данстон, Кори Хиггинс, Котти Кларк, ЦСКА Москва, Давиде Пасколо, ДеШон Томас, Донтэй Дрейпер, Евролига, Йоргос Принтезис, Джейси Кэрролл, Кит Лэнгфорд, Костас Папаниколау, Кайл Хайнс, Латовиус Уильямс, Марко Банич , Милош Теодосич, Нандо Де Коло, Олимпия Милан, Олимпиакос, Павел Антипов, Куино Колом, Раким Сандерс, Реал Мадрид, Томас Хёртель, Тайлер Ханикатт, УНИКС Казань, Вангелис Манцарис, Василис Спанулис, Веймир ПерасовичКомментарий
автор djordje1995, размещено в Евролиге
Реал Мадрид – Црвена Звезда 98-68
Надежды в экипировке Пабла Ласа с 12 победами на Густаво Айона (6 баллов и 5 и помощь), Йонаса Мациулиса (4 тройки и 2 украинца) и Джеффри Тейлора ( 4/6 fg), poen mamje dodali su Sergio Llull (10 ассистенций), Othello Hunter (4/4;fg и 8 очков) и Anthony Randolph (5 очков и 3 тройки).
Ekipu Dejana Radonjića, koja je grala bez Stefana Jovića, predvodio je Marko Simonović sa 13 poena dok je solidan bio and Charles Jenkins sa 10 poena i pet asistencija.
Anadolu Efes -Bamberg 68-87
Bamberg je u ovom kolu došao do iznanađujuće pobjede mod Lerasovog Efesa. До великого триумфа Nijemce su odveli Leon Radošević (16 poena 8/9 fg и 5 skokova), Maodo Lo (15 poena 5/8 fg) и Darius Miller (14 poena 6/7 fg и 6 skokova).
Перасову экипу предводили Су Седи Осман (15 поэна 5/11 фг до 7 лет) и Деррик Браун (13 поэна 5/12 фг и 4 часа).
Олимпиакос – Дарусафака 81-73
Пирейце по победе предводили Кхем Берч (13 очков 5/5 фг и 8 скоков), Мэтт Ложески (12 энтузиастов, 4/7 фг и 4 скока) и Эрик Грин с 11 энтузиастами.
Дарусафаку на предводили Брэда Ванамейкера (23 поэмы, 7/14 фг и помощника) и Уилла Клайберна (20 поен и 7 лет).
Жальгирис – Панатинаикос 64-58
Жальгирис на великом победе владельца Лео Вестерманн (14 поэнов, 6 посещений и 6 помощников) и Артураса Милакниса (13 поен и 3 тройки), по 2 поначалу многие додали и по Брок Мотум (4 пополам) ) и Паулюс Янкунас (8;скокова и 2 украинские лопте).
U redovima Panate se istaknuo trio Pappas (13 poena и 3 skoka)-Singleton (11 poena,6 skokova,3 blokade и 2 ukradene lopte)-Bourousis (10 poena и 5 skokova).
Барселона – Уникс Казань 70-62
Блауграну по важному владельцу Стратос Перпероглу (13 очков, 5/9 фг за 3 секунды и 3 украинских очка) и Виктор Клавер (12 очков, 4/6 фг и 2 украинских очка).
Goste koji su igrali bez Keitha Langforda predvodio je tandrm Antipov (12 poena)-Colom (10 poena,8 asista i 3 skoka).
Маккаби – Милан 92-82
Маккаби по имени Виктора Радда (17 баллов, 7/12 фг), Колтона Айверсона (16 баллов, 6/8 фг и 9 часов) и DJ Selley (15 баллов, 6/10) fg i 7 asista).
Большое количество оставшихся у исправлений Шминкера били су Ракима Сандерса (19 poena, 7/17fg) te Awudu Abass (13 poena, 3/8fg te četiri skoka)
Леандро Градашчевич, размещено в Евролиге
U 21.kolu Eurolige nvoe trijumfe su upisali: Fenerbahce, Žalgiris, Olympiacos i Bamberg.
Фенербахче- ЦСКА Москва -77-71
Najzaslužniji za veliki trijumf Obradovićevog tima bili su; Ekpe Udoh (15 poena,6/8 fg,11 skokova i 2 blockade) и Богдан Богданович (11 poena и 8 asista),10 poena i 6 skokova dodao je Гиги Датоме .
Moskovljane je sa 23 poena (4 trojke),4 asista i 3 skoka predvodio Nando De Colo ,11 poena,3 skoka,3 asista i 2 ukradene lopte dodao je Cory Higgins .
žalgiris kaunas- Barcelona Lassa -89-85
Najefikasniji U Pobjedičkom Timu Sa 17 Poena Bili Su: Lukas Lekavičuus (8/10 FG, 5 Skokova I 40007777777. fg, 4 skoka и 4 asista), 15 poena (4/7 fg) и 4 skoka upisao je Паулюс Янкунас ,poen manje uz 4 trojke dodao je Артурас Милакнис .
Надежный и проверенный завод, био и легендарный Хуан Карлос Наварро (17 баллов, 4 шага и 3 тройки), по 12 баллов, добавленных в Петтери Копонен, и Тайрес Мане, (7 запасов), рис (7 запасов), Додали су Витор Фаверани (5 скоков) и Джастин Доэллман (5 скоков).
УНИКС Казань -Олимпиакос-75-90
Najefikasniji u pobjedničkim redovima bili su Erick Green (25 баллов, 10/15 фг, 3 стакана и 3 тройки) и Giorgos Printezis (20 пеней, 9/13 фг, 4 помощника, 3 тройки и 3 стакана), 11 poena (5/7 fg) и 7 скока upisao je Nikola Milutinov , poen manje uz 4 asista 3 skoka dodao je Kostas Papnikolaou.
У домашнем времени истакнуо се Кейт Лэнгфорд (25 poena,7 asista i 3 trojke),17 poena (7/9) i 3 ukradene lopte upsiao je Павел Антипов ,2 poena manje uz 6 skokova i 3 asista dodao je Артем Параховский.
Brose Baskets Bamberg- Maccabi Fox Tel Aviv -90-75
Bamberg su do osme pobjede vodili Janis Strelnieks (25 poena, 10/10 ft, 5 trojki i 90 9007 (0 Dar 80 trojki i 4 asista) 17 poena, 7/10 fg), 13 poena (4/6 fg) и 3 тройки upisao je Maodo Lo , 3 poena manje uz 5 skokova и 2 poena dodao je Daniel Theis .
Эндрю Гудлок (22 поэна и 3 тройки) и Д.Дж. Seeley s (19 poena) для najefikasniji u redovima Maccabija.
Означено Эндрю Гудлок, Барселона Ласса, Богдан Богданович, Броуз Баскетс, Кори Хиггинс, ЦСКА Мсоква, Д.Дж. Сили, Дариус Миллер, Догус Даруссафака, Экпе Удох. , Эрик Грин, Евролига, Фенербахче, Гиоргос Принтезис, io, Янис Стрельниекс, Джастин Доэллман, Кит Лэнгфорд, Костас Папниколау, Луиджи Датоме, Лукас Лекавичюс, Маккаби Тель-Авив, Маодо Ло, Нандо Де Коло, Никола Милутинов, Олимпиакос, Паулиус Янкунас, Павел Антипов, Петтери Копонен, Тайриз Райс, УНИКС Казань, Витор Фаверани, Жальгирис Каунас, Желько ОбрадовичКомментарии
от Leandro gradaШевич, опубликованный в Euroliga
Izraelski Velikan Maccabi Je do nove Gostujuće Pobjede Stigao Kod .
Junak gostiju bio je Devin Smith (16 poena и 6 skokova), 12 poena и 6 skokova nanizao je Colton Iverson, poen manje uz 6 skokova and 4 asista dodao je D.J. Сили.
Standardno najbolji kod domaćina bio je Кит Лэнгфорд ( 22 poena i 3 asista), 12 poena postigao je Павел Антипов , 2 poena manje (fg 4/5) dodao je hrvatski internacionalac Marko Banić ( Ridl Basketball Agency ).
Означено Колтон Айверсон, Д.Дж. Сили, Девин Смит, Кит Лэнгфорд, Маккаби Тель-Авив, Марко Банич, Павел Антипов, Баскетбольное агентство Ридл., УНИКС КазаньКомментарии
SPAdes – Центр Алгоритмической Биотехнологии
Все о вирусах: новые коронаSPAdes, rnviralSPAdes и метавирусныеSPAdes пайплайны.
См. изменения в журнале изменений
Загрузить двоичные файлы SPAdes для Linux (только 64-разрядная версия)
Загрузить двоичные файлы SPAdes для MacOS
Загрузить исходный код SPAdes
- Руководство по SPAdes с руководством по установке (версия 3.15.4)
- То же руководство SPAdes в уценке
- РНКСПАдес ручной
- Руководство по truSPAdes (устарело)
- SPAdes на наборах данных GAGE-B эталонный тест
- Контрольный показатель для других наборов данных
Если у вас возникли проблемы с запуском SPAdes, вы можете найти похожую проблему в нашем репозитории GitHub, создать новый или написать нам по электронной почте: *protected email*.
Обратите внимание, что исполняемые файлы SPAdes могут не работать на новых ядрах Linux.
Подпишитесь на @spadesassembler или подпишитесь ниже
Примечание: для этого контента требуется JavaScript.
- МДА одноклеточный E. coli ; 6,3 Гб, 29 млн операций чтения, 2 x 100 п.н., размер вставки ~ 270 п.н. (Illumina Genome Analyzer IIx)
- Стандартный изолят E. coli ; 6,2 Гб, 28 млн прочтений, 2×100 п.н., размер вставки ~ 215 п.н. (Illumina Genome Analyzer IIx), также доступен в NCBI SRA (ERR008613)
- MDA одноклеточный S. aureus ; 14,6 Гб, 33 млн чтений, 2 x 100 п.н., размер вставки ~ 214 п.н. (Illumina Genome Analyzer IIx)
Дополнительные наборы данных, а также эталонные геномы доступны здесь.
E. coli K-12 MG1655 эталонная длина составляет 4639675 п.н. с 4324 аннотированными генами. S. aureus USA300 FPR3757 (хромосома и три плазмиды) эталонная длина составляет 2
9 п. н. с 2622 аннотированными генами.
Учитывались только контиги длиной 500 п.н. и длиннее. Таблицы были получены с использованием QUAST 4.6.3.
Сборка | НГ50 | # контигов | Крупнейший | Общая длина | МА | ММ | ИНД | ГФ (%) | # гены |
Одноклеточные E. coli | |||||||||
А5 | 14399 | 745 | 101584 | 4441145 | 3 | 11,92 | 0,19 | 89,867 | 3443 |
БЕЗДНА | 68534 | 179 | 178720 | 4345617 | 6 | 3,49 | 0,83 | 88,265 | 3704 |
CLC | 32506 | 503 | 113285 | 4656964 | 1 | 5,54 | 1,00 | 92. 286 | 3767 |
ЭЙЛЕР-SR | 26662 | 429 | 140518 | 4248713 | 12 | 9,98 | 20.17 | 84,846 | 3410 |
Рэй | 45448 | 361 | 210820 | 4379139 | 16 | 5,29 | 1,24 | 88,345 | 3634 |
СОАПденово | 1540 | 1166 | 51517 | 2958144 | 1 | 1,49 | 0,11 | 57,668 | 1766 |
Бархат | 22648 | 261 | 132865 | 3501984 | 2 | 2,19 | 1,17 | 73,761 | 3079 |
Э+В-СК | 32051 | 344 | 132865 | 4540286 | 2 | 2,26 | 0,70 | 91,727 | 3767 |
IDBA-UD contigs | 98306 | 244 | 284464 | 4814043 | 3 | 4,37 | 0,23 | 95. 158 | 4041 |
Подмости IDBA-UD | 109057 | 229 | 284464 | 4813609 | 3 | 4,42 | 0,75 | 95.145 | 4046 |
SPAdes 3.12 contigs | 105885 | 231 | 268283 | 4795250 | 3 | 2,02 | 0,30 | 94.853 | 4028 |
SPAdes 3.12 подмости | 117600 | 214 | 285212 | 4800301 | 3 | 2,41 | 0,61 | 94. 886 | 4030 |
Изолят E. coli | |||||||||
А5 | 43651 | 176 | 181690 | 4551797 | 0 | 0,40 | 0,09 | 98.017 | 4163 |
АБИСС | 106155 | 96 | 221861 | 4619631 | 2 | 3,72 | 0,37 | 98,969 | 4241 |
КЛК | 86964 | 112 | 221549 | 4550314 | 1 | 0,99 | 0,18 | 98. 057 | 4202 |
ЭЙЛЕР-SR | 110153 | 100 | 221409 | 4574240 | 4 | 3,14 | 5,43 | 98.092 | 4182 |
Рэй | 86246 | 98 | 221942 | 4634429 | 1 | 1,42 | 0,09 | 96,865 | 4136 |
СОАПденово | 49626 | 181 | 165487 | 4535469 | 0 | 0,15 | 0,09 | 97,696 | 4132 |
Бархат | 82776 | 120 | 242032 | 4554702 | 3 | 2,44 | 0,35 | 98. 131 | 4190 |
Э+В-СК | 54856 | 171 | 166115 | 4539639 | 0 | 1,30 | 0,11 | 97,792 | 4134 |
IDBA-UD contigs | 106844 | 110 | 221687 | 4565529 | 3 | 3,40 | 0,24 | 98,269 | 4200 |
Подмости IDBA-UD | 133098 | 93 | 284363 | 4565454 | 4 | 4,08 | 0,55 | 98. 282 | 4208 |
SPAdes 3.12 contigs | 125485 | 88 | 224545 | 4555008 | 1 | 1,93 | 0,18 | 98.092 | 4197 |
SPAdes 3.12 подмости | 133189 | 83 | 264976 | 4555437 | 1 | 1,98 | 0,22 | 98.090 | 4197 |
Одноэлементный S. aureus | |||||||||
А5 | 4829 | 937 | 41828 | 2770402 | 2 | 24,59 | 0,30 | 91,579 | 1815 |
АБИСС | 43173 | 185 | 175286 | 2899223 | 3 | 6,46 | 0,50 | 96.572 | 2458 |
ЭЙЛЕР-SR | 7247 | 750 | 66549 | 2988161 | 29 | 21,79 | 10,78 | 94,395 | 2009 |
Рэй | 62026 | 84 | 125177 | 2947717 | 12 | 1,40 | 0,44 | 92,960 | 2410 |
СОАПденово | 510 | 1047 | 27317 | 1473402 | 0 | 1,32 | 0,29 | 46. 717 | 595 |
Бархат | 15656 | 347 | 67677 | 2746768 | 3 | 4,41 | 4,27 | 93.181 | 2274 |
Э+В-СК | 32296 | 215 | 107657 | 2932416 | 5 | 6,89 | 5,03 | 97,497 | 2476 |
IDBA-UD contigs | 87549 | 114 | 175236 | 2996997 | 4 | 2,47 | 0,76 | 98. 658 | 2568 |
Подмости IDBA-UD | 111392 | 99 | 210360 | 2996115 | 4 | 2,54 | 1,46 | 98.681 | 2574 |
SPAdes 3.12 contigs | 174343 | 79 | 329332 | 2992317 | 4 | 2,68 | 0,49 | 98.483 | 2582 |
SPAdes 3.12 подмости | 195326 | 75 | 429070 | 2993815 | 4 | 2,96 | 0,49 | 98. 484 | 2582 |
A5 и CLC 3.22.55708 запускались с параметрами по умолчанию. ABySS 1.3.5, EULER-SR 2.0.1, Ray 2.2.0, SOAPdenovo 2.04, Velvet 1.2.07 и E+V-SC были запущены с размером вершины 55. IDBA-UD 1.1.0 был запущен в итерации по умолчанию. режим.
Общий размер сборки может увеличиваться (и в некоторых случаях превышать размер генома) из-за загрязнений (см. Chitsaz et al. (2011)), неправильно собранных контигов, повторов и хабов, которые способствуют множественным контигам. Процент 9Охваченные геномы 0408 E. coli и S. aureus отфильтровывают эти проблемы (столбец GF (%), фракция генома (%)).
Статистика NG50 такая же, как у N50, за исключением того, что используется размер генома, а не размер сборки.
Неправильные сборки (MA) — это места в собранном контиге, где левая фланкирующая последовательность выравнивается на расстоянии более 1 т.п.о. от правой фланкирующей последовательности в эталоне.
Частота ошибок несоответствия (подстановки) (MM) и количество вставок (IND) на 100 кбит/с измеряются в выровненных областях контигов.
В каждой колонке лучшие сборщики по данному критерию выделены жирным шрифтом . Сравнительный анализ гибридных сборок
SPAdes 3.12 на наборах данных Illumina + PacBio E. coli .
Сборка | НГ50 | # контигов | Самый большой | Общая длина | МА | ММ | ИНД | ГФ (%) | # гены |
E. coli K-12 Только Illumina | |||||||||
SPAdes 3. 12 contigs | 125485 | 99 | 224454 | 4557432 | 0 | 2,53 | 0,33 | 98.136 | 4196 |
E. coli K-12 Illumina + PacBio P4 | |||||||||
SPAdes 3.12 contigs | 4640965 | 5 | 4640965 | 4643912 | 0 (6*) | 11.41 | 1,12 | 99,968 | 4320 |
SPAdes 3.12 подмости | 4640965 | 5 | 4640965 | 4643912 | 0 (6*) | 11. 41 | 1,12 | 99,968 | 4320 |
* Неправильные сборки не соответствуют действительности и соответствуют разнице по отношению к эталону
Для контрольных показателей, которые мы использовали:
- E. coli K-12 MG1655 Стандартный изолят Illumina 90 набор данных3, указанный выше 90 набор данных86
- E. coli K-12 MG1655 Набор данных PacBio RS II C2/P4 доступен в PacBio DevNet
SPAdes 3.12 Тестирование IonTorrent на наборе данных E. coli .
Сборка | НГ50 | # контигов | Самый большой | Общая длина | МА | ММ | ИНД | ГФ (%) | # гены |
SPAdes 3.12 contigs | 133154 | 85 | 285138 | 4572473 | 3 | 3,44 | 3,39 | 98. 459 | 4204 |
SPAdes 3.12 подмости | 133154 | 83 | 285138 | 4572673 | 3 | 3,44 | 3,39 | 98.459 | 4204 |
«Я хотел бы поблагодарить вас за отличную работу, которую вы делаете со SPAdes. Это очень полезная программа!»
Лайонел Гай
Уппсальский университет, Швеция
«Спасибо за ваш замечательный ассемблер SPAdes, мы успешно собрали несколько культивируемых организмов, и ваш ассемблер всегда работал лучше других ассемблеров при работе на PE- и/или Обычно мы используем данные MP MiSeq».
Доктор Харальд Р. Грубер-Водицка
Symbiosis Group
Институт морской микробиологии им. Макса Планка, Бремен, Германия
«Я использовал SPAdes для исправления ошибок в данных метатранскриптома, и это значительно улучшило качество данных.