После записи с Вами свяжется специалист call-центра и уточнит все интересующие Вас вопросы.

Вы действительно хотите
прервать запись?

Вы можете записаться к врачу по телефону

Записаться на прием

07 мар 08 мар 09 мар 10 мар 

Психиатры с записью на ближайшее время

Чередниченко Николай Валерьевич

психиатр, нарколог

• Врач высшей квалификационной категории
• Кандидат медицинских наук

28 отзывов

Специализированная наркологическая клиника «Алкомед» у м. Багратионовская

Москва, улица Барклая, 13с1

Стоимость приема — 3750₽

Расписание работы врача

Царенко Дмитрий Михайлович

психиатр, психолог, психотерапевт

• Кандидат медицинских наук

38 отзывов

Психотерапевтический центр «Гранат»

Москва, 1-й Красносельский переулок, 11А

Стоимость приема — 5000₽

Расписание работы врача

Литвинов Александр Викторович

психиатр, психолог, психотерапевт

• Врач высшей квалификационной категории
• Кандидат медицинских наук

76 отзывов

Московский Городской Психоэндокринологический Центр

Москва, улица Арбат, 25/36

Расписание работы врача

У нас Вы можете найти врача в любом регионе России

Мы правильно определили Ваш регион?

Москва

Медицинский портал Все врачи здесь © 2010-2021

Оценка уровня смертности мишеней in vivo из-за опосредованного CD8 Т-клетками уничтожения

. 2008 г., декабрь 82 (23): 11749-57.

doi: 10.1128/ОВИ.01128-08. Epub 2008, 24 сентября.

Виталий В Ганусов ¹ , Роб Дж. Де Бур

принадлежность

• ¹ Теоретическая биология, Утрехтский университет, Падуалаан 8, 3584 CH Утрехт, Нидерланды. [email protected]

• PMID: 18815293
• PMCID: PMC2583656
• DOI: 10.1128/ОВИ.01128-08

Бесплатная статья ЧВК

Виталий В. Ганусов и др. Дж Вирол. 2008 9 декабря0003

Бесплатная статья ЧВК

. 2008 г., декабрь 82 (23): 11749-57.

doi: 10.1128/ОВИ.01128-08. Epub 2008, 24 сентября.

Авторы

Виталий В Ганусов ¹ , Роб Дж. Де Бур

принадлежность

• ¹ Теоретическая биология, Утрехтский университет, Падуалаан 8, 3584 CH Утрехт, Нидерланды. [email protected]

• PMID: 18815293
• PMCID: PMC2583656
• DOI: 10. 1128/ОВИ.01128-08

Абстрактный

Несмотря на недавние достижения в области иммунологии, несколько ключевых параметров, определяющих динамику вируса в инфицированных хозяевах, остаются в значительной степени неизвестными. Например, скорость, с которой специфические эффекторные клетки и Т-клетки памяти CD8 очищают инфицированные вирусом клетки in vivo, едва ли известна для какой-либо вирусной инфекции. Мы предлагаем основу для количественной оценки опосредованного Т-клетками уничтожения инфицированных клеток или клеток-мишеней, подвергнутых импульсному пептидному воздействию, с использованием широко используемого анализа цитотоксичности in vivo. Мы повторно проанализировали недавно опубликованные данные об уничтожении импульсированных пептидом спленоцитов цитотоксическими Т-лимфоцитами и Т-клетками памяти CD8, специфичными к NP39.6 и эпитопы GP276 вируса лимфоцитарного хориоменингита (LCMV) в селезенке мыши. Поскольку в селезенке мышей на пике иммунного ответа так много эффекторных CD8 Т-клеток, по оценкам, NP396- и GP276-импульсные мишени имеют очень короткие периоды полураспада — 2 и 14 минут соответственно. После того, как количество эффекторов уменьшилось, то есть у мышей, иммунных к LCMV, периоды полураспада становятся равными 48 мин и 2,8 ч для мишеней, экспрессирующих NP396 и GP276, соответственно. Анализ нескольких альтернативных моделей показывает, что на оценки времени полужизни пептидных мишеней не влияет изменение допущений модели. В нашем отчете представлена ​​унифицирующая основа для сравнения эффективности уничтожения Т-клеточных ответов CD8, специфичных для различных вирусных и бактериальных инфекций in vivo, которую можно использовать для сравнения эффективности различных вакцин на основе цитотоксических Т-лимфоцитов.

Цифры

РИС. 1.

Построение корреляции между числами…

РИС. 1.

Построение корреляций между количеством неимпульсных клеток, обнаруженных в селезенке при…

Построение корреляций между количеством неимпульсных клеток, обнаруженных в селезенке в разные моменты времени после переноса (показано в минутах), в зависимости от количества спленоцитов у остро инфицированных (A) или памяти (B) мышей. Существует положительная корреляция между общим количеством обнаруженных неимпульсных клеток и количеством спленоцитов для большинства проанализированных моментов времени. Это говорит о том, что скорость набора мишеней в селезенку зависит от размера селезенки.

РИС. 2.

Установка данных на…

РИС. 2.

Подгонка данных по рекрутированию клеток-мишеней в селезенку (А…

Подгонка данных по привлечению клеток-мишеней в селезенку (А и В) или по уничтожению клеток-мишеней в селезенке (от С до F). На панелях A и B показано рекрутирование неимпульсных мишеней в селезенке, а на панелях C-F показано снижение соотношения импульсных и неимпульсных мишеней в селезенке из-за опосредованного CD8 T-клетками уничтожения с течением времени. Панели A, C и D предназначены для остро инфицированных мышей, а панели B, E и F — для мышей с памятью. Панели C и E предназначены для NP39.мишени с 6 импульсами, а панели D и F предназначены для мишеней с импульсами GP276. Черные кружки обозначают измерения отдельных мышей, а черные линии обозначают логарифмическое среднее значение в момент времени. Серые прямоугольники показывают количество рекрутированных клеток, предсказанное моделью для отдельных мышей (A и B), или предсказанное среднее соотношение (C к F). Серые линии показывают логарифмическое среднее между индивидуально предсказанными значениями (A и B) или прогнозируемое среднее отношение (C к F). Обратите внимание на другую шкалу уничтожения клеток-мишеней у остро инфицированных (C и D) или памяти (E и F) мышей. Параметры, обеспечивающие наилучшее соответствие модели, показаны в таблице 1. RSS для этого соответствия составляет 65,55.

РИС. 3.

Максимальное (•) и минимальное (□)…

РИС. 3.

Максимальная (•) и минимальная (□) оценка скорости гибели клеток, подвергшихся импульсному пептидному воздействию…

Максимальная (•) и минимальная (□) оценки уровня гибели клеток, подвергнутых импульсному пептидному воздействию, из-за опосредованного Т-клетками уничтожения CD8, полученные при однократном измерении уничтожения клеток-мишеней, подвергнутых импульсному пептидному воздействию (с использованием уравнений 7 и 8). Средние максимальные оценки и стандартные отклонения следующие: 812 ± 1160 в день (NP396 острых [A]), 110 ± 68 в день (острый GP276 [B]), 23 ± 17 в день (память NP396 [C]) и 7 ± 4 в день (память GP276 [D]). Средние минимальные оценки и стандартные отклонения следующие: 68 ± 47 в день (NP396 острый), 35 ± 27 в день (GP276 острый), 8 ± 4 в день (NP396 память) и 3 ± 2 в день (GP276). Память). Пунктирные горизонтальные линии обозначают оценки смертности мишеней, которым вводили пептид, полученные путем подгонки данных временных рядов (см. рис. 2 и табл. 1). Большой разброс в индивидуальных оценках уровня смертности целей предполагает, что следует стремиться к проведению продольных анализов уничтожения, которые позволяют более точно оценить уровень смертности целей, подвергнутых импульсному пептидному воздействию. Эфф, эффектор; Мем, память.

РИС. 4.

Среднее количество целей…

РИС. 4.

Среднее количество клеток-мишеней, убитых за день одним эпитоп-специфическим эффектором…

Среднее количество клеток-мишеней, убитых в день одним эпитоп-специфическим эффектором или одной Т-клеткой памяти CD8. Количество клеток-мишеней, убитых в день, равно 9.0149 KT ( t )/ E , где T ( t ) — количество клеток-мишеней, взятых из данных, K — показатель смертности импульсных мишеней, а E — среднее количество эпитоп-специфических CD8 Т-клеток в селезенке (см. Таблицу 1). Обратите внимание, что, вычисляя среднее количество мишеней, убитых в день одной Т-клеткой CD8, мы не делаем никаких предположений о типе термина убийства. Также обратите внимание, что количество мишеней, убитых в день на одну Т-клетку CD8, не является эффективностью уничтожения Т-клеток CD8 на душу населения, как это было оценено в предыдущих исследованиях (37, 51). Среднее количество клеток-мишеней, убитых в день NP39.6-специфических эффекторных клеток или Т-клеток памяти CD8 составляет 0,7 или 5,4 соответственно, а специфических для GP276 эффекторных клеток или Т-клеток памяти CD8 составляет 1,2 или 4,2 клеток в день соответственно.

См. это изображение и информацию об авторских правах в PMC

Похожие статьи

• Немедленная цитотоксичность, но не дегрануляция, отличает эффекторные субпопуляции и подгруппы памяти CD8+ Т-клеток.

  Волинт П., Беттс М.Р., Куп Р.А., Оксениус А. Волинт П. и др. J Эксперт Мед. 2004 5 апреля; 199(7):925-36. doi: 10.1084/jem.20031799. Epub 2004 29 марта. J Эксперт Мед. 2004. PMID: 15051762 Бесплатная статья ЧВК.

• Затяжное течение инфекции вируса лимфоцитарного хориоменингита WE в раннем возрасте: индукция, но ограниченная экспансия эффекторных Т-клеток CD8+ и отсутствие Т-клеток памяти CD8+.

  Белноуэ Э., Фонтаназ-Боззотти П., Грилле С., Ламберт П. Х., Зигрист СА. Белнуэ Э. и соавт. Дж Вирол. 2007 г., июль; 81 (14): 7338-50. doi: 10.1128/ОВИ.00062-07. Epub 2007 9 мая. Дж Вирол. 2007. PMID: 17494081 Бесплатная статья ЧВК.

• Роль регулятора клеточного цикла E2F1 в регуляции ответов Т-клеток CD8 при острой и хронической вирусной инфекции.

  Гао X, Тевари К., Сварен Дж., Суреш М. Гао Х и др. Вирусология. 2004 г., 1 июля; 324 (2): 567-76. doi: 10.1016/j.virol.2004.04.012. Вирусология. 2004. PMID: 15207641

• Дисфункция Т-клеток CD8 при хронической вирусной инфекции.

  Шин Х., Уэрри Э.Дж. Шин Х и др. Курр Опин Иммунол. 2007 авг; 19 (4): 408-15. doi: 10.1016/j.coi. 2007.06.004. Epub 2007 25 июля. Курр Опин Иммунол. 2007. PMID: 17656078 Обзор.

• Т-клетки памяти в иммунотерапии рака: какая популяция Т-клеток CD8 обеспечивает наилучшую защиту от опухолей?

  Перре Р., Рончес Ф. Перре Р. и соавт. Тканевые антигены. 2008 г., сен; 72 (3): 187–94. doi: 10.1111/j.1399-0039.2008.01088.x. Epub 2008 9 июля. Тканевые антигены. 2008. PMID: 18627571 Обзор.

Посмотреть все похожие статьи

Цитируется

• Двойное действие иммунных клеток в микроокружении опухоли: про- и противоопухолевые эффекты и их триггеры.

  Пенья-Ромеро AC, Оренес-Пиньеро Э. Пенья-Ромеро А.С. и соавт. Раков (Базель). 2022 25 марта; 14 (7): 1681. doi: 10.3390/раки14071681. Раков (Базель). 2022. PMID: 35406451 Бесплатная статья ЧВК. Обзор.

• Пространственно распределенная инфекция увеличивает вирусную нагрузку в вычислительной модели легочной инфекции SARS-CoV-2.

  Мозес М.Э., Хофмейр С., Кэннон Дж.Л., Эндрюс А., Гридли Р., Хинга М., Лейба К., Прибисова А., Сурджадиджаджа В., Тасним Х., Форрест С. Моисей М.Э. и др. PLoS Comput Biol. 2021 23 декабря; 17(12):e1009735. doi: 10.1371/journal.pcbi.1009735. электронная коллекция 2021 дек. PLoS Comput Biol. 2021. PMID: 34941862 Бесплатная статья ЧВК.

• Цитотоксические Т-клетки способны эффективно уничтожать раковые клетки за счет аддитивной цитотоксичности.

  Вайгелин Б., Ден Бур А.Т., Вагена Э. , Броен К., Долстра Х., де Бур Р.Дж., Фигдор К.Г., Текстор Дж., Фридл П. Вейгелин Б. и соавт. Нац коммун. 2021 1 сентября; 12 (1): 5217. doi: 10.1038/s41467-021-25282-3. Нац коммун. 2021. PMID: 34471116 Бесплатная статья ЧВК.

• Оценка моделей уничтожения CD8 Т-клеток с помощью компьютерного моделирования экспериментов с двухфотонной визуализацией.

  Растоги А., Роберт П.А., Халле С., Мейер-Херманн М. Растоги А. и соавт. PLoS Comput Biol. 2020 28 декабря; 16 (12): e1008428. doi: 10.1371/journal.pcbi.1008428. Электронная коллекция 2020 декабрь. PLoS Comput Biol. 2020. PMID: 33370254 Бесплатная статья ЧВК.

• Гетерогенное убийство с отсроченным началом Т-клеток с множественным поражением: стохастическое моделирование для оценки методов анализа данных визуализации.

  Бек Р.Дж., Бийкер Д.И., Белтман Дж.Б. Бек Р.Дж. и соавт. PLoS Comput Biol. 2020 13 июля; 16 (7): e1007972. doi: 10.1371/journal.pcbi.1007972. электронная коллекция 2020 июль. PLoS Comput Biol. 2020. PMID: 32658891 Бесплатная статья ЧВК.

Просмотреть все статьи «Цитируется по»

Типы публикаций

термины MeSH

Количественная оценка оборота клеток с использованием данных CFSE

. 2005 март; 298 (1-2): 183-200.

doi: 10.1016/j.jim.2005.01.011.

Виталий В Ганусов ¹ , Сергей С. Пилюгин, Роб Дж. де Бур, Кая Мурали-Кришна, Рафи Ахмед, Рустом Антиа

Принадлежности

принадлежность

• ¹ Факультет биологии, Университет Эмори, Атланта, Джорджия 30322, США. [email protected]

• PMID: 15847808
• DOI: 10.1016/j.jim.2005.01.011

Виталий В. Ганусов и др. Дж Иммунол Методы. 2005 март

. 2005 март; 298 (1-2): 183-200.

doi: 10.1016/j.jim.2005.01.011.

Авторы

Виталий В Ганусов ¹ , Сергей С. Пилюгин, Роб Дж. де Бур, Кая Мурали-Кришна, Рафи Ахмед, Рустом Антиа

принадлежность

• ¹ Факультет биологии, Университет Эмори, Атланта, Джорджия 30322, США. [email protected]

• PMID: 15847808
• DOI: 10.1016/j.jim.2005.01.011

Абстрактный

Анализ разбавления красителя CFSE широко используется для определения количества делений, которым подверглась данная клетка, меченная CFSE, in vitro и in vivo. В данной работе мы рассматриваем, как данные, полученные с помощью CFSE (данные CFSE), можно использовать для оценки параметров, определяющих деление и гибель клеток. Для однородной клеточной популяции (т. е. популяции, в которой параметры клеточного деления и гибели не зависят от времени и числа претерпевших делений клеток) мы рассматриваем конкретную биологически обоснованную модель клеточного оборота «Смит-Мартин» и анализируем три различные методики оценки его параметров: прямая аппроксимация, косвенная аппроксимация и метод масштабирования. Мы находим, что, используя только данные CFSE, продолжительность фазы деления (т. Е. Примерно S + G2 + M фаза клеточного цикла) может быть оценена с использованием любого метода. В некоторых случаях среднее время деления или клеточного цикла можно оценить с помощью прямой подгонки модельного решения к данным или с помощью метода Гетта-Ходжкина [Gett A. and Hodgkin, P. 2000. Клеточный расчет для интеграции сигналов Т-клетками. Нац. Иммунол. 1:239-244]. Оценка уровня смертности во время приверженности к делению (т. е. приблизительно в фазе G1 клеточного цикла) и во время фазы деления может оказаться невозможной с использованием только данных CFSE. Мы предполагаем, что измерение дополнительного параметра, доли клеток в делении, может позволить оценить все параметры модели, включая уровень смертности на разных стадиях клеточного цикла.

Похожие статьи

• Оценка деления лимфоцитов и показателей смертности по данным CFSE.

  Де Бур Р.Дж., Ганусов В.В., Милутинович Д., Ходжкин П.Д., Перельсон А.С. Де Бур Р.Дж. и др. Бык Математика Биол. 2006 июль; 68 (5): 1011-31. doi: 10.1007/s11538-006-9094-8. Epub 2006 16 мая. Бык Математика Биол. 2006. PMID: 16832737

• Моделирование пролиферации и гибели Т-клеток in vitro на основе данных мечения: обобщения модели клеточного цикла Смита-Мартина.

  Ли Х.И., Перельсон А.С. Ли ХИ и др. Бык Математика Биол. 2008 Январь; 70 (1): 21-44. doi: 10.1007/s11538-007-9239-4. Epub 2007, 15 августа. Бык Математика Биол. 2008. PMID: 17701260

• Измерение пролиферации, выживания и дифференцировки лимфоцитов с использованием данных временного ряда CFSE.

  Хокинс Э.Д., Хоммель М. , Тернер М.Л., Бэтти Ф.Л., Маркхэм Дж.Ф., Ходжкин П.Д. Хокинс ЭД и соавт. Нат Проток. 2007;2(9):2057-67. doi: 10.1038/nprot.2007.297. Нат Проток. 2007. PMID: 17853861

• Анализ деления клеток in vivo и in vitro с использованием проточного цитометрического измерения разбавления красителя CFSE.

  Лайонс AB. Лайонс АБ. Дж Иммунол Методы. 2000 г., 21 сентября; 243 (1–2): 147–54. doi: 10.1016/s0022-1759(00)00231-3. Дж Иммунол Методы. 2000. PMID: 10986412 Обзор.

• Моделирование роста и дифференцировки Т- и В-клеток.

  Каллард Р., Ходжкин П. Каллард Р. и соавт. Immunol Rev. 2007 Apr; 216:119-29. doi: 10.1111/j.1600-065X.2006.00498.x. Иммунол Ред. 2007. PMID: 17367338 Обзор.

Посмотреть все похожие статьи

Цитируется

• Cyton2: модель динамики популяции иммунных клеток, включающая семейное обучение по наследству.

  Чеон Х., Кан А., Преведелло Г., Остинди С.К., Доведи С.Дж., Хокинс Э.Д., Марчинго Д.М., Хайнцель С., Даффи К.Р., Ходжкин П.Д. Чеон Х. и др. Фронт Биоинформ. 2021 26 окт;1:723337. doi: 10.3389/fbinf.2021.723337. Электронная коллекция 2021. Фронт Биоинформ. 2021. PMID: 36303793 Бесплатная статья ЧВК.

• FAMoS: гибкий и динамичный алгоритм выбора модели для анализа динамики сложных систем.

  Гэйбл М., Холь Т., Имле А., Факлер О.Т., Грау Ф. Гейбл М. и др. PLoS Comput Biol. 2019 16 августа; 15 (8): e1007230. doi: 10. 1371/journal.pcbi.1007230. Электронная коллекция 2019 авг. PLoS Comput Biol. 2019. PMID: 31419221 Бесплатная статья ЧВК.

• Математическое моделирование контактного дерматита от никеля и хрома.

  Уорд Дж. П., Фрэнкс С. Дж., Тиндалл М. Дж., Кинг Дж. Р., Кертис А., Эванс Г. С. Уорд Дж. П. и соавт. Дж. Матем. Биол. 2019Июль; 79 (2): 595-630. doi: 10.1007/s00285-019-01371-2. Epub 2019 13 июня. Дж. Матем. Биол. 2019. PMID: 31197444 Бесплатная статья ЧВК.

• Иммунные синапсы между тучными клетками и γδ Т-клетками ограничивают вирусную инфекцию.

  Mantri CK, Сент-Джон, Алабама. Мантри С.К. и др. Джей Клин Инвест. 1 марта 2019 г.; 129(3):1094-1108. DOI: 10.1172/JCI122530. Epub 2019 4 февраля. Джей Клин Инвест.